26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0196 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
532 aa  1027    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4673  hypothetical protein  33.99 
 
 
524 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0277  hypothetical protein  34.08 
 
 
524 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3007  hypothetical protein  29.52 
 
 
528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00741341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4583  permease  33.18 
 
 
526 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0750795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1743  hypothetical protein  31.13 
 
 
508 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.169376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2748  hypothetical protein  29.11 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1688  hypothetical protein  22.87 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  23.62 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0058  hypothetical protein  23.11 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3062  putative ABC transporter, permease  23.24 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0298  uncharacterized membrane protein, putative  22.85 
 
 
532 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  22.12 
 
 
552 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2058  hypothetical protein  23.61 
 
 
624 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000378817  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0303  putative ABC transporter permease protein  22.43 
 
 
532 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  21.91 
 
 
552 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  21.91 
 
 
552 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  21.91 
 
 
552 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  21.91 
 
 
552 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  21.91 
 
 
552 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  22.83 
 
 
552 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15300  hypothetical protein  22.72 
 
 
534 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  20.79 
 
 
552 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2121  putative ABC transporter, permease  20.94 
 
 
551 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3356  hypothetical protein  21.65 
 
 
552 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0408  hypothetical protein  24.3 
 
 
553 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>