18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0408 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0408  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1083    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  24.66 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0298  uncharacterized membrane protein, putative  24.8 
 
 
532 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1688  hypothetical protein  24.43 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0303  putative ABC transporter permease protein  24.8 
 
 
532 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  20.6 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4673  hypothetical protein  24.92 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  20.82 
 
 
552 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3062  putative ABC transporter, permease  22.15 
 
 
554 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00181769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3356  hypothetical protein  21.33 
 
 
552 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  20.63 
 
 
552 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  20.63 
 
 
552 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  20.45 
 
 
552 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  20.45 
 
 
552 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  20.45 
 
 
552 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
532 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2121  putative ABC transporter, permease  20.47 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  20.78 
 
 
552 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>