50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0123 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0123  acyl-coA-binding protein ACBP  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000595584  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0103  acyl-CoA-binding protein  68.67 
 
 
88 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000596303  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3085  putative acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0394  acyl-CoA-binding protein  59.76 
 
 
88 aa  105  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044876  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0342  acyl-CoA-binding protein  70.15 
 
 
85 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2484  acyl-coA-binding protein ACBP  57.14 
 
 
89 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515409  hitchhiker  0.000620664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2000  acyl-CoA-binding protein  56.47 
 
 
89 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1134  acyl-CoA-binding protein  54.76 
 
 
84 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2522  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2466  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3734  acyl-CoA-binding protein  54.65 
 
 
86 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1947  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2078  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1583  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1358  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3227  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.457766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2611  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2085  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3532  acyl-CoA-binding protein  51.81 
 
 
84 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1653  putative acyl-CoA-binding protein  51.19 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192969  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1366  acyl-CoA-binding protein  52.38 
 
 
105 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.322711  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0773  acyl-CoA-binding protein  55.42 
 
 
84 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859936  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4041  acyl-CoA-binding protein  51.81 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3509  acyl-CoA-binding protein  54.22 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1231  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.162101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1394  acyl-CoA-binding protein  55.42 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971038  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0455  acyl-CoA-binding protein  52.38 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628298  normal  0.491613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1305  acyl-coA-binding protein ACBP  53.57 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150747  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2065  acyl-CoA-binding protein  54.12 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6031  acyl-CoA-binding protein  54.12 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5355  Acyl-CoA-binding protein, ACBP  54.12 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0446  acyl-coA-binding protein ACBP  52.38 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330336  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2046  acyl-CoA-binding protein  54.12 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1239  acyl-coA-binding protein ACBP  52.38 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451854  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1366  acyl-CoA-binding protein  51.76 
 
 
89 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1940  acyl-CoA-binding protein AcbP  51.76 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0347  acyl-coA-binding protein ACBP  50 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4032  acyl-coA-binding protein ACBP  52.38 
 
 
86 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000477077  normal  0.553982 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31029  predicted protein  48.68 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32604  predicted protein  44.87 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000696357  normal  0.053185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3254  acyl-CoA-binding protein  42.68 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.264963  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01420  long-chain fatty acid transporter, putative  39.56 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03160  long-chain fatty acid transporter, putative  42.05 
 
 
406 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34529  predicted protein  40.54 
 
 
394 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05904  Acyl CoA binding protein family (AFU_orthologue; AFUA_2G11060)  32.14 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.979863 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  45.76 
 
 
494 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2596  acyl-CoA-binding protein  35.71 
 
 
89 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01062  Acyl CoA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12300)  38.1 
 
 
376 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0773441 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14734  predicted protein  37.31 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48778  predicted protein  39.34 
 
 
351 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>