13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0471 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0471  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0338  hypothetical protein  30.37 
 
 
189 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0405  hypothetical protein  36.46 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0439  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0407  hypothetical protein  31 
 
 
184 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.233585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1743  hypothetical protein  28.87 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0478046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0404  hypothetical protein  30.85 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0442  hypothetical protein  32.63 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.116693  normal  0.471069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2279  protein of unknown function Spy-related  23.78 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0337  hypothetical protein  27.37 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  26.28 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0470  hypothetical protein  28.74 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0906  hypothetical protein  29.73 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.121389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>