26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0046 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0924747  normal  0.0206503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0014  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0089  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.548412  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>