13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3828 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3828    100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00255391  normal  0.0427496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 741 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.55 
 
 		 777 bp  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  85.96 
 
 		 684 bp  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.55 
 
 		 708 bp  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.43 
 
 		 696 bp  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  93.55 
 
 		 696 bp  46.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  96.3 
 
 		 684 bp  46.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  93.33 
 
 		 684 bp  44.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  96.15 
 
 		 690 bp  44.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  93.33 
 
 		 693 bp  44.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  96.15 
 
 		 684 bp  44.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  100 
 
 		 1095 bp  44.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>