19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1579 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1579  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2214  hypothetical protein  57.89 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2201  hypothetical protein  49.02 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3920  hypothetical protein  43.14 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0802  hypothetical protein  47.06 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0665  hypothetical protein  47.06 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1218  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114739  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1493  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1114  hypothetical protein  46.67 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.377277  normal  0.142186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3983  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262413  normal  0.447927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3526  hypothetical protein  48.84 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.839258  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2117  hypothetical protein  47.22 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449177  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2402  hypothetical protein  40.48 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0371811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2176  hypothetical protein  47.22 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.572915  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2338  hypothetical protein  46.81 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2130  hypothetical protein  47.22 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27830  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0214542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3297  hypothetical protein  39.22 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3995  hypothetical protein  52.27 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00216255  normal  0.238179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>