31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27830  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0214542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1418  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3995  hypothetical protein  57.81 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00216255  normal  0.238179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0665  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2130  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2176  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.572915  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2117  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449177  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2402  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3983  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262413  normal  0.447927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1459  hypothetical protein  48.44 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2201  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0802  hypothetical protein  51.67 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3920  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1218  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114739  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1461  hypothetical protein  46.88 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000951069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3297  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3526  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.839258  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1782  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17700  hypothetical protein  44.64 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.578813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2214  hypothetical protein  48.15 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1493  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1114  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.377277  normal  0.142186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2452  hypothetical protein  46.3 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1388  hypothetical protein  43.86 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.905929  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4184  hypothetical protein  43.86 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.578507  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1424  hypothetical protein  42.11 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0916527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2338  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07220  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.281963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23210  hypothetical protein  37.29 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  0.0901448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1579  hypothetical protein  45.1 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1241  hypothetical protein  32.81 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>