55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1895 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1895  acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  327  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.203233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1663  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
159 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0095  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0938241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1688  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04470  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.33 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0776164  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.069585 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  23.65 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000012608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
160 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
170 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  24.31 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3193  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00122797  hitchhiker  0.000000000468815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  22.37 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  21.05 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  21.05 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  22 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  20.42 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  22.37 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  20.83 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220294 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  21.13 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  21.13 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  22.93 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  21.13 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  21.64 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  21.32 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  21.32 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5539  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  23.21 
 
 
161 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  22.92 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0790  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0316  ribosomal protein-alanine-acetyltransferase  29.36 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0238467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4218  GCN5-related N-acetyltransferase  21.37 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3222  acetyltransferase  29.35 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  22.92 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>