28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2486 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2486  sporulation protein YabP  100 
 
 		 95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000342083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2800  sporulation protein YabP  94.95 
 
 		 99 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000715998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2659  YabP-like protein  39.36 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000200526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0690  YabP family protein  38.78 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.733874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00460  YabP family protein  39.13 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0222  sporulation protein YabP  39.51 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000487754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0088  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000856369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3083  sporulation protein YabP  34.38 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0135  sporulation protein YabP  39.29 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000150113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0138  sporulation protein YabP  38.55 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0118  YabP family protein  32.56 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0053  sporulation protein YabP  39.51 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0055  sporulation protein YabP  39.51 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00412609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0053  YabP family protein  37.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.218275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0067  sporulation protein YabP  37.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00209322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0064  sporulation protein YabP  37.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0057  yabP protein  37.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000658102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0053  hypothetical protein  37.04 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.175441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0053  hypothetical protein  37.04 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000330321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0057  yabP protein  37.04 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.493381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0056  yabP protein  37.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.070874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0063  sporulation protein YabP  38.27 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5253  sporulation protein YabP  37.04 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0053  YabP family protein  38.27 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0072  sporulation protein YabP  30.11 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0650  YabP family protein  37.65 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000871774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0077  YabP family protein  31.11 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0085  hypothetical protein  39.39 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>