30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2659 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2659  YabP-like protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000200526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3083  sporulation protein YabP  54.17 
 
 
94 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0690  YabP family protein  43.88 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.733874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0650  YabP family protein  43.16 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000871774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2800  sporulation protein YabP  38.38 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000715998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2486  sporulation protein YabP  39.36 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000342083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00460  YabP family protein  37.37 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0135  sporulation protein YabP  39.18 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000150113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0072  sporulation protein YabP  41.18 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000630985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0118  YabP family protein  37.5 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0053  sporulation protein YabP  41.67 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0053  YabP family protein  39.29 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0055  sporulation protein YabP  41.67 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00412609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0057  yabP protein  38.1 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.493381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0064  sporulation protein YabP  38.1 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0067  sporulation protein YabP  38.1 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00209322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0053  YabP family protein  38.1 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.218275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0057  yabP protein  38.1 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000658102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0053  hypothetical protein  38.1 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.175441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0053  hypothetical protein  38.1 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000330321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0056  yabP protein  38.1 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.070874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0063  sporulation protein YabP  38.1 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5253  sporulation protein YabP  38.1 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000389897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0088  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000856369  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0222  sporulation protein YabP  31.87 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000487754  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0077  YabP family protein  34.04 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0085  hypothetical protein  33.72 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0138  sporulation protein YabP  35.71 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2067  YabP family protein  37.84 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0188  YabP family protein  38.46 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>