91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2019 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2019  stage V sporulation protein AC  100 
 
 
155 aa  309  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2304  stage V sporulation protein AC  98.71 
 
 
155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1561  SpoVA protein  58.9 
 
 
148 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0122  SpoVA protein  57.25 
 
 
147 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.385931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2731  stage V sporulation protein AC  56.95 
 
 
152 aa  166  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1106  SpoVA protein  56.03 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1659  stage V sporulation protein AC  52.86 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.493863  normal  0.375555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0626  spore formation protein spoVAC  52.86 
 
 
155 aa  160  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2282  stage V sporulation protein AC  52.14 
 
 
147 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1248  stage V sporulation protein AC  51.08 
 
 
161 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1376  SpoVA protein  50 
 
 
170 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07050  Sporulation stage V protein AC  45.77 
 
 
149 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1222  SpoVA protein  49.29 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000481736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0479  stage V sporulation protein AC  47.33 
 
 
167 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0788  stage V sporulation protein AC  43.23 
 
 
159 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4939  sporulation stage V protein AC  42.95 
 
 
158 aa  140  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5249  stage V sporulation protein AC  42.31 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1654  stage V sporulation protein AC  43.87 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3688  sporulation stage V protein AC  42.31 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3439  stage V sporulation protein AC  51.32 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0227  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5307  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0208  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5375  stage v sporulation protein ac  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5265  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5692  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4995  stage V sporulation protein AC  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5231  SpoVA family protein  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4824  stage V sporulation protein AC  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4839  stage V sporulation protein AC  41.67 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1061  SpoVA family protein  44.76 
 
 
152 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0415842  normal  0.102128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4177  SpoVA family protein  44.76 
 
 
152 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0136798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3825  stage V sporulation protein AC  44.37 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.460621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3809  stage V sporulation protein AC  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.403654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4200  SpoVA family protein  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2767  sporulation stage V protein AC  40.97 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.428102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4137  stage V sporulation protein AC  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0686624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4089  SpoVA family protein  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000123549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4289  stage v sporulation protein ac  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3979  stage V sporulation protein AC  45.07 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3898  sporulation stage V protein AC  42.25 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1743  stage V sporulation protein AC  42.55 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2381  stage V sporulation protein AC  44.76 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0720  stage V sporulation protein AC  44.93 
 
 
157 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1465  SpoVA protein  41.4 
 
 
159 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2247  SpoVA protein  34.72 
 
 
145 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0377  SpoVA protein  30.28 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1656  stage V sporulation protein AE  34.88 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0790  stage V sporulation protein AE  36.13 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1063  stage V sporulation protein AE  38.83 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2198  normal  0.21703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5690  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0229  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5377  stage V sporulation protein AE  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4841  stage V sporulation protein AE  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0206  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5233  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0722  stage V sporulation protein AE  48.86 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4826  stage V sporulation protein AE  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5251  stage V sporulation protein AE, truncation  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5267  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4941  sporulation stage V protein AE  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4997  stage V sporulation protein AE  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5309  SpoVA family protein  38.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4175  stage V sporulation protein AE  38.38 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3807  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  37.86 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3896  sporulation stage V protein AE  38.83 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.18857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4198  stage V sporulation protein AE  37.86 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000578449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3823  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  37.86 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3977  stage V sporulation protein AE  37.86 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4087  stage V sporulation protein AE  37.86 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000720162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3690  sporulation stage V protein AE  36.59 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1463  SpoVA protein  35.66 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2379  stage V sporulation protein AE  36.8 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.134026  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2765  sporulation stage V protein AE  39.18 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.60711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1741  stage V sporulation protein AE  42.27 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2245  SpoVA protein  35.24 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1220  SpoVA protein  40.23 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000192439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07070  Sporulation stage V protein AE  35.34 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2733  stage V sporulation protein AE  39.02 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2017  stage V sporulation protein AE  35.35 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2302  stage V sporulation protein AE  35.35 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1563  SpoVA protein  36.17 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.807903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3437  stage V sporulation protein AE  39.33 
 
 
120 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1657  stage V sporulation protein AE  33.66 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.449041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1108  SpoVA protein  34.78 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0124  SpoVA protein  38.16 
 
 
118 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00762492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1374  SpoVA protein  33.72 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.523405  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1246  stage V sporulation protein AE  33.71 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0379  SpoVA protein  34.29 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0481  stage V sporulation protein AE  34.78 
 
 
118 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2280  stage V sporulation protein AE  41.18 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>