90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0124 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0124  SpoVA protein  100 
 
 
118 aa  224  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00762492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2733  stage V sporulation protein AE  64.96 
 
 
117 aa  157  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2017  stage V sporulation protein AE  66.96 
 
 
121 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2302  stage V sporulation protein AE  66.96 
 
 
121 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1563  SpoVA protein  62.71 
 
 
131 aa  147  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.807903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2280  stage V sporulation protein AE  72.03 
 
 
118 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3437  stage V sporulation protein AE  60.53 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1108  SpoVA protein  54.39 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1374  SpoVA protein  57.26 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.523405  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1656  stage V sporulation protein AE  49.56 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0481  stage V sporulation protein AE  47.46 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0790  stage V sporulation protein AE  49.56 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1463  SpoVA protein  48.67 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3690  sporulation stage V protein AE  45.22 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2379  stage V sporulation protein AE  45.22 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.134026  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1220  SpoVA protein  55.56 
 
 
118 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000192439  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0206  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5251  stage V sporulation protein AE, truncation  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5233  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4941  sporulation stage V protein AE  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5690  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5267  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4997  stage V sporulation protein AE  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4826  stage V sporulation protein AE  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5309  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5377  stage V sporulation protein AE  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0229  SpoVA family protein  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4841  stage V sporulation protein AE  44.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1657  stage V sporulation protein AE  43.86 
 
 
117 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.449041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2765  sporulation stage V protein AE  47.79 
 
 
117 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.60711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07070  Sporulation stage V protein AE  43.86 
 
 
117 aa  103  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4198  stage V sporulation protein AE  46.09 
 
 
116 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000578449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4087  stage V sporulation protein AE  46.09 
 
 
116 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000720162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3977  stage V sporulation protein AE  46.09 
 
 
116 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3807  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  46.09 
 
 
116 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3823  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  46.09 
 
 
116 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4175  stage V sporulation protein AE  45.22 
 
 
116 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3896  sporulation stage V protein AE  44.35 
 
 
116 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.18857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1063  stage V sporulation protein AE  44.35 
 
 
116 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2198  normal  0.21703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1741  stage V sporulation protein AE  45.22 
 
 
119 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0628  SpoVA protein  57.14 
 
 
119 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0722  stage V sporulation protein AE  46.02 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1246  stage V sporulation protein AE  53.85 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2245  SpoVA protein  38.26 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0379  SpoVA protein  42.86 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0406  stage V sporulation protein AE, C-terminal region  34.72 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2767  sporulation stage V protein AC  31.73 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.428102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1654  stage V sporulation protein AC  33.33 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2282  stage V sporulation protein AC  34.21 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1376  SpoVA protein  35.34 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3898  sporulation stage V protein AC  29.41 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1743  stage V sporulation protein AC  29.07 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0788  stage V sporulation protein AC  32.61 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4177  SpoVA family protein  28.85 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0136798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2304  stage V sporulation protein AC  36.84 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1061  SpoVA family protein  28.85 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0415842  normal  0.102128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1106  SpoVA protein  34.62 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0122  SpoVA protein  31.58 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.385931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2731  stage V sporulation protein AC  40.51 
 
 
152 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3825  stage V sporulation protein AC  27.72 
 
 
152 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4939  sporulation stage V protein AC  33.7 
 
 
158 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0720  stage V sporulation protein AC  29.06 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5249  stage V sporulation protein AC  33.7 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3688  sporulation stage V protein AC  33.7 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4137  stage V sporulation protein AC  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0686624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3979  stage V sporulation protein AC  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3809  stage V sporulation protein AC  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.403654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4289  stage v sporulation protein ac  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4089  SpoVA family protein  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000123549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4200  SpoVA family protein  27.72 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1465  SpoVA protein  28.41 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0227  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5231  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5692  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4995  stage V sporulation protein AC  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5265  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2381  stage V sporulation protein AC  30.53 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4824  stage V sporulation protein AC  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4839  stage V sporulation protein AC  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0208  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5375  stage v sporulation protein ac  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5307  SpoVA family protein  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0626  spore formation protein spoVAC  33.72 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0479  stage V sporulation protein AC  34.52 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1659  stage V sporulation protein AC  32.95 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.493863  normal  0.375555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07050  Sporulation stage V protein AC  34.21 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2247  SpoVA protein  28.57 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1561  SpoVA protein  31.58 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1248  stage V sporulation protein AC  35.37 
 
 
161 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1222  SpoVA protein  30.34 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000481736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>