26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1364 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1364  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  100 
 
 
231 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0128009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1622  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  96.54 
 
 
231 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0335216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0633  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  43.75 
 
 
212 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0037  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  37.13 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0729  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  42.17 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2869  hypothetical protein  36.46 
 
 
201 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10030  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  37.06 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0166  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  35.93 
 
 
181 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0280  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.08 
 
 
185 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3476  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  34.5 
 
 
200 aa  95.1  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4644  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  34.52 
 
 
200 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2120  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  32.56 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000587957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4930  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  30.53 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5066  hypothetical protein  30.53 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4705  hypothetical protein  30.53 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4967  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4562  thiamine transporter  30.53 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0482993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4950  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  30.53 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4544  thiamine transporter  30 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0275  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  32.12 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0304  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  28.31 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4935  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  28.31 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0359  hypothetical protein  30.52 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0817  hypothetical protein  32.5 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1529  hypothetical protein  29.27 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.419261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1261  thiamine transporter  35.59 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00651567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>