24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1073 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1073  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00858865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1260  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000180212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3725  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3748  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0169698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3375  hypothetical protein  48.21 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.115745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3706  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000141339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3752  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3394  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3443  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3478  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1518  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3797  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0678  hypothetical protein  56.52 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2342  hypothetical protein  48.08 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1198  hypothetical protein  43.33 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2602  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00731389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1429  hypothetical protein  46.94 
 
 
79 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0671601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1402  hypothetical protein  46.94 
 
 
79 aa  43.9  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000939998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0587  protein of unknown function DUF896  51.22 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00722399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1806  protein of unknown function DUF896  42 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000777264  hitchhiker  0.000778347 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0911  hypothetical protein  42.11 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1239  protein of unknown function DUF896  43.18 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2121  protein of unknown function DUF896  45.45 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0541  hypothetical protein  47.73 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000511623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>