41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0678 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0678  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343355  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0971  hypothetical protein  56.25 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0187116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0541  hypothetical protein  55.71 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000511623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1429  hypothetical protein  53.52 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0671601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1402  hypothetical protein  53.52 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000939998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0271  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0794  hypothetical protein  49.37 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000029483  hitchhiker  5.449040000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0911  hypothetical protein  51.47 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117812  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1198  hypothetical protein  49.32 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2121  protein of unknown function DUF896  45.59 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3375  hypothetical protein  45.59 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.115745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3797  hypothetical protein  44.44 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1518  hypothetical protein  45.59 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3443  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3725  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3748  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0169698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3478  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3394  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3706  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000141339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3752  hypothetical protein  44.12 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1239  protein of unknown function DUF896  44.12 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2342  hypothetical protein  52.54 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2596  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2650  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3438  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.550917  hitchhiker  0.00000000000388802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1981  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1932  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.27406e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1900  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000668889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1737  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00586218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1708  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2007  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2602  hypothetical protein  43.4 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00731389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1758  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000143248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1759  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000516404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1897  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000617246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1073  hypothetical protein  56.52 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00858865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1260  hypothetical protein  56.52 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000180212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0587  protein of unknown function DUF896  43.4 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00722399  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl350  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.5883e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1806  protein of unknown function DUF896  55 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000777264  hitchhiker  0.000778347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0970  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.740003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>