17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0871 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0871  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4023  protein of unknown function DUF1648  30 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919179  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  25 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  28.24 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  32.94 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  28.74 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  26.9 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  28.24 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2918  hypothetical protein  24.65 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  29.27 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  30.19 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  40.82 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  45.95 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  24.64 
 
 
212 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  24.64 
 
 
212 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  27.68 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>