12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0112 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0110  hypothetical protein  97.3 
 
 		 74 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0232545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0469  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2547  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000287526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4011  hypothetical protein  35.48 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1792  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1667  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3084  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0996883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2867  hypothetical protein  38.1 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3593  hypothetical protein  30.65 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0118946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4708  hypothetical protein  37.1 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3456  hypothetical protein  29.41 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.531845  normal  0.85923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>