20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3084 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3084  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0996883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0544  hypothetical protein  69.44 
 
 
72 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0510  hypothetical protein  69.44 
 
 
72 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1792  hypothetical protein  51.47 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1667  hypothetical protein  49.28 
 
 
75 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4011  hypothetical protein  43.48 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2547  hypothetical protein  46.88 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000287526  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3593  hypothetical protein  47.83 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0118946  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3456  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.531845  normal  0.85923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0753  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000110363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0659  hypothetical protein  37.1 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.933716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0469  hypothetical protein  28.79 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2729  hypothetical protein  46.03 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00096908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3323  hypothetical protein  32.35 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0158  hypothetical protein  40.58 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000182848  unclonable  9.68695e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2354  hypothetical protein  30.88 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0112  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0110  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0232545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2867  hypothetical protein  30 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3927  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>