23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2873 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2873  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2556  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1488  protein of unknown function DUF1667  57.02 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2645  hypothetical protein  51.64 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.789876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08120  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  46.61 
 
 
131 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1626  protein of unknown function DUF1667  48.7 
 
 
115 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1550  protein of unknown function DUF1667  42.24 
 
 
123 aa  104  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3392  hypothetical protein  48.28 
 
 
118 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0699  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1023  hypothetical protein  41.38 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000786771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1326  hypothetical protein  38.98 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000472266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0322  hypothetical protein  40.35 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0257775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1360  hypothetical protein  38.14 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00743628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0618  hypothetical protein  41.38 
 
 
120 aa  92  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1241  protein of unknown function DUF1667  43.93 
 
 
119 aa  92  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1238  protein of unknown function DUF1667  39.32 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.417506  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0681  protein of unknown function DUF1667  40.18 
 
 
131 aa  90.5  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0789691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1530  protein of unknown function DUF1667  38.79 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06280  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  39.32 
 
 
570 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0023  protein of unknown function DUF1667  39.32 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0281  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0932  protein of unknown function DUF1667  36.28 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0136  hypothetical protein  37.93 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>