25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0994 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0994  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.305034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1487  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.631841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0882  hypothetical protein  97.5 
 
 
55 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0114377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0693  hypothetical protein  31.4 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2069  hypothetical protein  42.25 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2048  hypothetical protein  38.81 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00376314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1830  hypothetical protein  38.81 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000128862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3360  hypothetical protein  38.81 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182726  hitchhiker  0.00000000000000469053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02190  hypothetical protein  35.82 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1967  hypothetical protein  43.64 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1779  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  25.53 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  37.14 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1796  hypothetical protein  41.67 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1999  hypothetical protein  41.67 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5878499999999998e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1036  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  31.15 
 
 
211 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000572382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  28.74 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  28.74 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  27.87 
 
 
211 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  27.87 
 
 
211 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4509  protein of unknown function DUF1648  33.33 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.193955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  33.77 
 
 
220 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  27.87 
 
 
211 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>