24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0713 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  924    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.368373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3573  ECF-type sigma factor negative effector  25.55 
 
 		 368 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1769  ECF-type sigma factor negative effector  27.44 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1887  ECF-type sigma factor negative effector  27.95 
 
 		 368 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0097805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1579  ECF-type sigma factor negative effector  27.95 
 
 		 368 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000789717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1804  ECF-type sigma factor negative effector  27.22 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1830  hypothetical protein  25.15 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1627  hypothetical protein  28.35 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000443713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1754  hypothetical protein  28.35 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000104759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0524  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.717938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1588  ECF-type sigma factor negative effector  26.75 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000623788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0540  hypothetical protein  26.15 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000049289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2114  hypothetical protein  26.25 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3699  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000331334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1618  hypothetical protein  32.26 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000288116  hitchhiker  0.0000140623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0913  hypothetical protein  23.74 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000265204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1327  hypothetical protein  23.22 
 
 		 323 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000343633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3606  hypothetical protein  32.97 
 
 		 332 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000697848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3614  hypothetical protein  31.52 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3648  hypothetical protein  27.96 
 
 		 332 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000308551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3382  hypothetical protein  27.96 
 
 		 332 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000129987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3274  hypothetical protein  26.76 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000264398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3296  hypothetical protein  26.88 
 
 		 332 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000409943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3599  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000176649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>