13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1470 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1470  toxin-antitoxin protein, putative  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0047  hypothetical protein  50.79 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00713717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  24.77 
 
 
111 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.77 
 
 
111 aa  42  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  24.77 
 
 
111 aa  42  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  25.47 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  24.77 
 
 
111 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  24.77 
 
 
111 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  22.73 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  25.71 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  24.77 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  24.77 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  25.96 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>