23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2585 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2585  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2195  hypothetical protein  45 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0828402  normal  0.627418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0854  hypothetical protein  47.46 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2445  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174632  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1829  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897002  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2440  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2355  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.251994  normal  0.280946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1210  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000107283  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2487  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2309  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.027643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1622  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0045965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1052  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1045  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2977  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5771  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0677074  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0850  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3486  hypothetical protein  41.67 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1012  hypothetical protein  41.67 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2598  hypothetical protein  40.35 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0646  hypothetical protein  39.29 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2385  hypothetical protein  40.35 
 
 
62 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0670  hypothetical protein  40.35 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2194  hypothetical protein  52.78 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>