35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4219 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4219  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3119  hypothetical protein  64.52 
 
 
70 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0452  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0562  hypothetical protein  41.18 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1876  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1937  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2032  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0907  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0963  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4573  hypothetical protein  36.62 
 
 
72 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5097  hypothetical protein  36.62 
 
 
72 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0444  hypothetical protein  36.62 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212091  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5178  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3189  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5101  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3480  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.279354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3472  hypothetical protein  38.36 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.13535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1150  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0118283  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4065  hypothetical protein  37.88 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145781  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4523  hypothetical protein  37.88 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.283879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1013  hypothetical protein  34.92 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852587  normal  0.0612153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5707  hypothetical protein  34.92 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2781  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000676939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4996  hypothetical protein  36.76 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6766  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.409795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0158  hypothetical protein  29.69 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6396  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.265103 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1440  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1851  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561698  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1942  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0168  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0481  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5887  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34344  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5523  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0292109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0900.1  hypothetical protein  30.88 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>