37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4523 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4523  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.283879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4065  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145781  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1150  hypothetical protein  86.49 
 
 
74 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0118283  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5523  hypothetical protein  82.43 
 
 
74 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0292109  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5887  hypothetical protein  82.43 
 
 
74 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34344  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6396  hypothetical protein  82.43 
 
 
74 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.265103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6766  hypothetical protein  78.38 
 
 
74 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.409795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4996  hypothetical protein  78.38 
 
 
74 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2781  hypothetical protein  77.03 
 
 
74 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000676939  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5372  hypothetical protein  70.27 
 
 
74 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.543433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2595  hypothetical protein  52.63 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279668  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0900.1  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1440  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1851  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561698  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1942  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0168  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0481  hypothetical protein  63.24 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5178  hypothetical protein  46.38 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3189  hypothetical protein  46.38 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5101  hypothetical protein  46.38 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4573  hypothetical protein  44.29 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5097  hypothetical protein  44.29 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0444  hypothetical protein  44.93 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212091  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3480  hypothetical protein  44.93 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.279354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3472  hypothetical protein  45.83 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.13535 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0452  hypothetical protein  42.65 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0562  hypothetical protein  42.65 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1013  hypothetical protein  44.62 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852587  normal  0.0612153 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1876  hypothetical protein  42.65 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1937  hypothetical protein  42.65 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2032  hypothetical protein  42.65 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5707  hypothetical protein  44.62 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0907  hypothetical protein  42.65 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0963  hypothetical protein  44.78 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0158  hypothetical protein  42.19 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4219  hypothetical protein  37.88 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3119  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.824643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>