17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2016 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2016  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0593972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2195  hypothetical protein  78.05 
 
 
123 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402265  decreased coverage  0.00169589 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1600  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.740309  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5211  hypothetical protein  46.34 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.258485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4544  hypothetical protein  45.57 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1782  putative lipoprotein  50.65 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.904026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0863  putative lipoprotein  50.65 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1385  putative lipoprotein  50.65 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0490  putative lipoprotein  50.65 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1622  hypothetical protein  50.65 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0667  putative lipoprotein  50.65 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0943002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4045  hypothetical protein  44.87 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0613626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4321  hypothetical protein  44.87 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3480  hypothetical protein  43.84 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3440  hypothetical protein  41.56 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0559628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3947  hypothetical protein  41.56 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.807672  normal  0.538327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2035  hypothetical protein  41.03 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0205332  normal  0.157135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>