17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1385 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0667  putative lipoprotein  100 
 
 
89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0943002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1622  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0490  putative lipoprotein  100 
 
 
89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1385  putative lipoprotein  100 
 
 
89 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1782  putative lipoprotein  98.88 
 
 
102 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.904026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0863  putative lipoprotein  98.88 
 
 
102 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1600  hypothetical protein  97.65 
 
 
103 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.740309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4045  hypothetical protein  59.74 
 
 
110 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0613626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4321  hypothetical protein  59.74 
 
 
110 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4544  hypothetical protein  55.13 
 
 
137 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3480  hypothetical protein  58.33 
 
 
80 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2035  hypothetical protein  53.25 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0205332  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3440  hypothetical protein  51.32 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0559628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3947  hypothetical protein  51.32 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.807672  normal  0.538327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2016  hypothetical protein  50.57 
 
 
123 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0593972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2195  hypothetical protein  49.43 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402265  decreased coverage  0.00169589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5211  hypothetical protein  36.14 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.258485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>