17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0857 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0857  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584889  normal  0.298433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3819  hypothetical protein  82.84 
 
 
146 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00178925  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5494  hypothetical protein  45.53 
 
 
134 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3640  hypothetical protein  45.53 
 
 
134 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4965  hypothetical protein  45.53 
 
 
134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2334  hypothetical protein  43.9 
 
 
134 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4598  hypothetical protein  43.09 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3765  hypothetical protein  43.09 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155002  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3758  hypothetical protein  43.09 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276815  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6778  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3181  hypothetical protein  30.7 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4538  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5699  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5160  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5323  hypothetical protein  30.21 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3113  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857162  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4970  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17052  normal  0.326794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>