28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6778 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6778  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3819  hypothetical protein  31.93 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00178925  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3640  hypothetical protein  36.52 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5494  hypothetical protein  36.52 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4965  hypothetical protein  36.52 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4598  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3758  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276815  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3765  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155002  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2334  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584889  normal  0.298433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0003  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1429  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0004  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1149  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0638625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0003  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1508  hypothetical protein  37.08 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0754251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0003  Serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.293394  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7006  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5323  hypothetical protein  39.44 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3023  hypothetical protein  35.64 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4970  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17052  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3113  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857162  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5699  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5160  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4538  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4157  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0003  hypothetical protein  37.97 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3181  hypothetical protein  36.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>