34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16180  Protein of unknown function (DUF797)  100 
 
 
62 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0211334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2175  hypothetical protein  68.18 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00489951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1918  protein of unknown function DUF797  78.79 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000647128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2243  hypothetical protein  57.89 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2970  protein of unknown function DUF797  78.12 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165845  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11910  Protein of unknown function (DUF797)  50 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4462  hypothetical protein  82.76 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3192  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516588  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3142  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1791  hypothetical protein  75 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1494  protein of unknown function DUF797  82.76 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.026873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12143  hypothetical protein  82.14 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0287467  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3076  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2360  hypothetical protein  79.31 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0376484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3450  hypothetical protein  82.14 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552119  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2462  protein of unknown function DUF797  82.14 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0161544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1872  protein of unknown function DUF797  64.29 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2239  protein of unknown function DUF797  69.7 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192803  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2158  protein of unknown function DUF797  46.88 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2644  hypothetical protein  75 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.772222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20880  Protein of unknown function (DUF797)  79.31 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1487  protein of unknown function DUF797  82.76 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22040  Protein of unknown function (DUF797)  46.15 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00887509  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0909  protein of unknown function DUF797  75 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5879  hypothetical protein  75.86 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107356  normal  0.769255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2680  protein of unknown function DUF797  75 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136561  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2309  protein of unknown function DUF797  75.86 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1835  hypothetical protein  75 
 
 
69 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2425  protein of unknown function DUF797  72.41 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00189878  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1187  hypothetical protein  68.97 
 
 
71 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208283  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2002  protein of unknown function DUF797  61.7 
 
 
64 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.425274  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2628  hypothetical protein  65.62 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942181  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4880  hypothetical protein  65.62 
 
 
72 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2240  protein of unknown function DUF797  68.97 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>