34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2240 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2240  protein of unknown function DUF797  100 
 
 		 64 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22040  Protein of unknown function (DUF797)  81.25 
 
 		 63 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00887509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2158  protein of unknown function DUF797  75 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3076  hypothetical protein  73.44 
 
 		 64 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3450  hypothetical protein  71.88 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12143  hypothetical protein  73.44 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3192  hypothetical protein  73.44 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516588  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3142  hypothetical protein  73.44 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2462  protein of unknown function DUF797  73.44 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0161544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1187  hypothetical protein  73.08 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2970  protein of unknown function DUF797  75 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165845  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2644  hypothetical protein  56.92 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.772222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1835  hypothetical protein  77.27 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5879  hypothetical protein  82.05 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107356  normal  0.769255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2628  hypothetical protein  69.57 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942181  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2309  protein of unknown function DUF797  81.58 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4880  hypothetical protein  67.39 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1494  protein of unknown function DUF797  72.73 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.026873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2425  protein of unknown function DUF797  68.18 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00189878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2243  hypothetical protein  58.93 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1791  hypothetical protein  81.08 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2680  protein of unknown function DUF797  68.42 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2360  hypothetical protein  57.14 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0376484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4462  hypothetical protein  65.79 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11910  Protein of unknown function (DUF797)  49.25 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0909  protein of unknown function DUF797  45.31 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2002  protein of unknown function DUF797  54.72 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.425274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2175  hypothetical protein  46.77 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16180  Protein of unknown function (DUF797)  45.31 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0211334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20880  Protein of unknown function (DUF797)  76.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1872  protein of unknown function DUF797  73.33 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1487  protein of unknown function DUF797  76.67 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1918  protein of unknown function DUF797  74.19 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000647128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2239  protein of unknown function DUF797  70.97 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>