23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5262 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5262  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1335  hypothetical protein  47.73 
 
 
179 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5789  hypothetical protein  48.04 
 
 
179 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485812  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3853  hypothetical protein  47.73 
 
 
179 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4515  hypothetical protein  47.73 
 
 
179 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.028542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2708  hypothetical protein  40.48 
 
 
174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000631521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2527  hypothetical protein  38.64 
 
 
176 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3608  hypothetical protein  36.93 
 
 
172 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3473  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0769  hypothetical protein  26.84 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0443737  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5790  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0211  hypothetical protein  32.95 
 
 
363 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677911  normal  0.283207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2526  hypothetical protein  34.04 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0216  hypothetical protein  27.65 
 
 
350 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0205  hypothetical protein  27.06 
 
 
350 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0193  hypothetical protein  26.47 
 
 
350 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3020  hypothetical protein  23.03 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3296  hypothetical protein  23.03 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3258  hypothetical protein  23.03 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3318  hypothetical protein  22.42 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3075  hypothetical protein  22.42 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1380  hypothetical protein  25.45 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000269855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4868  hypothetical protein  24.12 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359447  unclonable  0.00000012465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>