13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0374 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0374  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164484  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0856  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0827  hypothetical protein  97.86 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361657  hitchhiker  0.000378008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0729  hypothetical protein  88.73 
 
 		 140 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3945  hypothetical protein  82.24 
 
 		 151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00708448  normal  0.0378742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0746  hypothetical protein  88.49 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2532  hypothetical protein  79.56 
 
 		 139 aa  209  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0284021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1455  hypothetical protein  55.14 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0037  hypothetical protein  49.56 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1160  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.832806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  31.18 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2749  hypothetical protein  24.58 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000635552  hitchhiker  0.000000696723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3151  hypothetical protein  24.58 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.222616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>