11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0729 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  282  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0374  putative transmembrane anti-sigma factor  88.73 
 
 		 150 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164484  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0856  putative transmembrane anti-sigma factor  89.93 
 
 		 140 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0827  hypothetical protein  89.21 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361657  hitchhiker  0.000378008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3945  hypothetical protein  91.34 
 
 		 151 aa  240  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00708448  normal  0.0378742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0746  hypothetical protein  91.49 
 
 		 140 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2532  hypothetical protein  79.85 
 
 		 139 aa  213  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0284021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1455  hypothetical protein  46.62 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0037  hypothetical protein  48.21 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1160  hypothetical protein  43.28 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.832806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  32.69 
 
 		 204 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>