29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2750 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2750  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2137  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2775  hypothetical protein  98.8 
 
 
333 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2799  hypothetical protein  90.39 
 
 
333 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2666  hypothetical protein  90.09 
 
 
333 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0549  hypothetical protein  91.29 
 
 
333 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0663  hypothetical protein  73.96 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0825  hypothetical protein  73.96 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2517  hypothetical protein  78.12 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0049  hypothetical protein  78.12 
 
 
299 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2895  hypothetical protein  78.12 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2190  hypothetical protein  78.12 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0649  hypothetical protein  78.47 
 
 
340 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2217  hypothetical protein  59.25 
 
 
337 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.685913  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1407  hypothetical protein  57.36 
 
 
326 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54896  normal  0.251254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5981  hypothetical protein  59.87 
 
 
337 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589392  normal  0.48413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0020  hypothetical protein  58.5 
 
 
315 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1032  hypothetical protein  44.04 
 
 
348 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3423  hypothetical protein  43.4 
 
 
350 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  44.84 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1192  hypothetical protein  37.46 
 
 
320 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1066  hypothetical protein  37.5 
 
 
354 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0973  hypothetical protein  39.66 
 
 
330 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1676  hypothetical protein  29.35 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617002  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1704  hypothetical protein  30.03 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1225  hypothetical protein  30.03 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1131  hypothetical protein  30.03 
 
 
337 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.238037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1120  hypothetical protein  30.03 
 
 
337 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1767  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>