29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1120 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1131  hypothetical protein  97.03 
 
 		 337 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1676  hypothetical protein  82.79 
 
 		 337 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1704  hypothetical protein  82.79 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1225  hypothetical protein  82.79 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1032  hypothetical protein  30.67 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  31.07 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1066  hypothetical protein  31.34 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0020  hypothetical protein  31.74 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0825  hypothetical protein  31.47 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0663  hypothetical protein  31.47 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2517  hypothetical protein  31.71 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0049  hypothetical protein  31.71 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2895  hypothetical protein  31.71 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2190  hypothetical protein  31.71 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1407  hypothetical protein  31.4 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54896  normal  0.251254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5981  hypothetical protein  31.87 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589392  normal  0.48413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2217  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.685913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0649  hypothetical protein  31.36 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2799  hypothetical protein  32.31 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2666  hypothetical protein  32.31 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2750  hypothetical protein  30.03 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2137  hypothetical protein  30.03 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2775  hypothetical protein  29.35 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1767  hypothetical protein  28.72 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3423  hypothetical protein  29.02 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0549  hypothetical protein  31.36 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1192  hypothetical protein  26.92 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0973  hypothetical protein  24.09 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>