13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0489 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0489  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  305  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02840  hypothetical protein  46.41 
 
 
154 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03400  hypothetical protein  31.33 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1863  hypothetical protein  32.06 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1866  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0621  hypothetical protein  27.41 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2990  hypothetical protein  23.12 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0594  hypothetical protein  26.35 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.397631  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_562  hypothetical protein  25.93 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5175  hypothetical protein  27.21 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1124  hypothetical protein  27.85 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.407641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3078  hypothetical protein  27.78 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0515  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>