11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3078 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3078  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  326  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1866  hypothetical protein  68.12 
 
 
144 aa  183  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1292  hypothetical protein  54.29 
 
 
150 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484627  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2990  hypothetical protein  41.55 
 
 
168 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0515  hypothetical protein  41.43 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02840  hypothetical protein  27.46 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1124  hypothetical protein  29.81 
 
 
173 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.407641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0594  hypothetical protein  29.68 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.397631  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_562  hypothetical protein  27.95 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03400  hypothetical protein  28.39 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0621  hypothetical protein  29.03 
 
 
162 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>