12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3210 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0125335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3210  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.015375  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0115852  hitchhiker  0.0016148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3150  hypothetical protein  96.43 
 
 		 56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02559  hitchhiker  0.0000000130062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0110  hypothetical protein  82.14 
 
 		 56 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000258359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0125  hypothetical protein  82.14 
 
 		 56 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0316  hypothetical protein  80.36 
 
 		 60 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000219572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0080  hypothetical protein  80.36 
 
 		 60 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000464049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3966  hypothetical protein  62.5 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3093  hypothetical protein  57.69 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108345  hitchhiker  0.00000000000104633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>