16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3032 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3032  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2895  hypothetical protein  94.84 
 
 
150 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3005  hypothetical protein  76.88 
 
 
155 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2371  hypothetical protein  76.77 
 
 
155 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2985  hypothetical protein  76.77 
 
 
155 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2979  hypothetical protein  77.56 
 
 
154 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6334  hypothetical protein  75.48 
 
 
171 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2282  hypothetical protein  40.99 
 
 
192 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0958  hypothetical protein  40.26 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1044  hypothetical protein  39.35 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2872  hypothetical protein  34.62 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1502  hypothetical protein  35.22 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7574  hypothetical protein  35.21 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4957  hypothetical protein  31.82 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0562333  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6765  hypothetical protein  32.21 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.127414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3124  hypothetical protein  33.8 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0722858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>