16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2895 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2895  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  296  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3032  hypothetical protein  94.84 
 
 
155 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3005  hypothetical protein  78.06 
 
 
155 aa  226  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2371  hypothetical protein  77.42 
 
 
155 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2985  hypothetical protein  77.42 
 
 
155 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2979  hypothetical protein  77.42 
 
 
154 aa  219  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6334  hypothetical protein  77.42 
 
 
171 aa  216  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2282  hypothetical protein  42 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0958  hypothetical protein  38.96 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1044  hypothetical protein  39.35 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1502  hypothetical protein  39.74 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2872  hypothetical protein  34.64 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7574  hypothetical protein  36.5 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6765  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.127414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4957  hypothetical protein  36.55 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0562333  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3124  hypothetical protein  35.04 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0722858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>