16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2691 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2691  TonB family protein  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2564  TonB family protein  98.28 
 
 
116 aa  227  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2673  TonB family protein  91.38 
 
 
116 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2033  TonB-like  90.52 
 
 
149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0290203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2644  TonB family protein  90.52 
 
 
149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5971  TonB-like protein  89.66 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0659  TonB family protein  87.93 
 
 
195 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0652  TonB domain-containing protein  60.34 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2682  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2394  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0825  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0007  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0282  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
143 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0983  TonB domain-containing protein  59.48 
 
 
143 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0821  TonB domain-containing protein  62.24 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  31.76 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>