33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2218 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2096  phosphoesterase, DHHA1  98.47 
 
 
326 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2218  phosphoesterase, DHHA1  100 
 
 
326 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5491  phosphoesterase, DHHA1  88.04 
 
 
326 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2197  phosphoesterase, DHHA1  86.81 
 
 
326 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5898  phosphoesterase, DHHA1  87.42 
 
 
326 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2179  phosphoesterase, DHHA1  87.42 
 
 
326 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1092  phosphoesterase DHHA1  86.46 
 
 
358 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1947  hypothetical protein  63.72 
 
 
321 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2674  hypothetical protein  63.92 
 
 
348 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2534  hypothetical protein  63.61 
 
 
348 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1423  hypothetical protein  63.92 
 
 
348 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3165  hypothetical protein  63.92 
 
 
348 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2149  hypothetical protein  63.92 
 
 
348 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2587  hypothetical protein  63.61 
 
 
348 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1535  hypothetical protein  57.64 
 
 
320 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0354085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1648  hypothetical protein  62.28 
 
 
292 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0913  hypothetical protein  46.98 
 
 
317 aa  288  7e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.794051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0209  hypothetical protein  49.68 
 
 
319 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2625  phosphoesterase, DHHA1  48.2 
 
 
320 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0597601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1895  hypothetical protein  46.52 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3048  hypothetical protein  44.55 
 
 
317 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002241  hypothetical protein  42.95 
 
 
318 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7036  hypothetical protein  46.58 
 
 
324 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5924  hypothetical protein  49.02 
 
 
319 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430354  normal  0.775458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2146  hypothetical protein  40.3 
 
 
332 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00127  acetyltransferase  43.13 
 
 
318 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2956  acetyltransferase  42.09 
 
 
321 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1690  acetyltransferase  43.04 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.287562  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2984  acetyltransferase  42.09 
 
 
321 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0801  acetyltransferase  41.53 
 
 
319 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000975488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0824  hypothetical protein  44.09 
 
 
329 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.213126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2737  hypothetical protein  41.03 
 
 
319 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.306253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0928  hypothetical protein  43.69 
 
 
331 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>