15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6260 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4080  putative phenylacetaldoxime dehydratase  92.26 
 
 		 352 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6546  putative phenylacetaldoxime dehydratase  99.14 
 
 		 350 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4286  putative phenylacetaldoxime dehydratase  92.26 
 
 		 352 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3231  phenylacetaldoxime dehydratase  91.98 
 
 		 352 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470184  normal  0.481728 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6260  phenylacetaldoxime dehydratase  100 
 
 		 350 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.510249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2724  phenylacetaldoxime dehydratase  75.5 
 
 		 352 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2540  Phenylacetaldoxime dehydratase  57.35 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0988  phenylacetaldoxime dehydratase  47.7 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814886  normal  0.662912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4765  putative phenylacetaldoxime dehydratase  46 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0006  putative phenylacetaldoxime dehydratase.  42.82 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0211  phenylacetaldoxime dehydratase  28.96 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0670  Phenylacetaldoxime dehydratase  34.87 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0081  Phenylacetaldoxime dehydratase  33.13 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1560  phenylacetaldoxime dehydratase  29.74 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929309  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03240  conserved hypothetical protein  22.63 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.384145  normal  0.821467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>