32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5553 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5553  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1727  hypothetical protein  60.96 
 
 
193 aa  231  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0389  hypothetical protein  51.03 
 
 
196 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1742  hypothetical protein  50.52 
 
 
196 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0297  hypothetical protein  50.52 
 
 
196 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1863  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.743344  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1158  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2135  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0871  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2353  hypothetical protein  46.88 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76932  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2182  hypothetical protein  52.06 
 
 
196 aa  171  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1726  hypothetical protein  43.28 
 
 
208 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2354  hypothetical protein  37.81 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550165  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5554  hypothetical protein  42.35 
 
 
205 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2183  hypothetical protein  41.06 
 
 
212 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1159  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0296  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0388  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0872  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1741  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1864  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18918  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2136  hypothetical protein  38.16 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2846  hypothetical protein  30.66 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  hitchhiker  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1865  hypothetical protein  52.73 
 
 
106 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0387  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1160  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0873  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0295  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2137  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2184  hypothetical protein  49.09 
 
 
131 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000468  hypothetical protein  27.2 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0103318  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5555  hypothetical protein  45.45 
 
 
62 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>