29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5555 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5555  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1725  hypothetical protein  59.68 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2184  hypothetical protein  54.1 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1865  hypothetical protein  50.82 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2137  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0295  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0387  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1160  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0873  hypothetical protein  50.82 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1158  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2135  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0297  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0871  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1863  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.743344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1742  hypothetical protein  46.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0389  hypothetical protein  51.85 
 
 
196 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2355  hypothetical protein  43.86 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596272  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2183  hypothetical protein  44.23 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5554  hypothetical protein  43.14 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5553  hypothetical protein  45.45 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0388  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0296  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1741  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1864  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18918  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0872  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2354  hypothetical protein  41.51 
 
 
208 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.550165  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2136  hypothetical protein  40.82 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1727  hypothetical protein  43.4 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>