14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3092 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3208  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000169853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3092  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000134148  hitchhiker  0.00398181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6511  hypothetical protein  93.91 
 
 
115 aa  224  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445683  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2542  hypothetical protein  93.91 
 
 
115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000589374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3155  hypothetical protein  93.91 
 
 
115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000363908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3174  hypothetical protein  93.91 
 
 
115 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317028  hitchhiker  0.00000240387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3148  hypothetical protein  88.7 
 
 
115 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614605  hitchhiker  0.000000000105803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0318  hypothetical protein  81.74 
 
 
115 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000396991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0113  hypothetical protein  81.74 
 
 
115 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000285642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0129  hypothetical protein  81.74 
 
 
115 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0171997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0082  hypothetical protein  81.74 
 
 
115 aa  203  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000108644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3091  hypothetical protein  48.7 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0010404  hitchhiker  0.00000000000104633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3964  hypothetical protein  44.35 
 
 
112 aa  105  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4478  hypothetical protein  43.48 
 
 
112 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  unclonable  0.00000114817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>