49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2589 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2717  hypothetical protein  97.53 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2693  hypothetical protein  96.3 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2664  hypothetical protein  95.06 
 
 		 81 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2053  hypothetical protein  95.06 
 
 		 81 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5992  hypothetical protein  92.59 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0633  hypothetical protein  87.65 
 
 		 81 aa  146  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05427  hypothetical protein  75.31 
 
 		 82 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2219  hypothetical protein  79.75 
 
 		 82 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3055  protein of unknown function DUF1272  78.48 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3311  protein of unknown function DUF1272  78.48 
 
 		 83 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4946  hypothetical protein  74.07 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.054584  normal  0.404077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0580  hypothetical protein  72.15 
 
 		 83 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2387  hypothetical protein  70.89 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.652223  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2394  hypothetical protein  66.67 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3443  hypothetical protein  66.67 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40610  hypothetical protein  65.38 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2580  hypothetical protein  71.62 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.418372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1036  hypothetical protein  67.57 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3484  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2781  protein of unknown function DUF1272  70.83 
 
 		 75 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0090  protein of unknown function DUF1272  57.5 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.1015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3411  hypothetical protein  65.33 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2351  hypothetical protein  64 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2163  hypothetical protein  58.97 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162616  normal  0.033863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0162  hypothetical protein  64.38 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.156045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2237  hypothetical protein  55.56 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4148  hypothetical protein  59.15 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000130778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2529  hypothetical protein  58.11 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.763354  hitchhiker  0.00703113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2780  hypothetical protein  57.33 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0961  hypothetical protein  64.38 
 
 		 77 aa  91.3  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1157  hypothetical protein  65.33 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3399  protein of unknown function DUF1272  59.21 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3174  protein of unknown function DUF1272  62.67 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0129  protein of unknown function DUF1272  55.13 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0480  hypothetical protein  58.11 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7015  protein of unknown function DUF1272  55.07 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232527  hitchhiker  0.00370389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0568  hypothetical protein  51.28 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3033  hypothetical protein  55.22 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0121303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1267  protein of unknown function DUF1272  54.39 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3100  hypothetical protein  57.14 
 
 		 57 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3382  hypothetical protein  55.36 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3407  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1849  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3426  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3405  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2140  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3395  hypothetical protein  52.73 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2298  hypothetical protein  54.39 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159548  normal  0.783685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>