15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1820 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1096  putative lipoprotein  71.18 
 
 
730 aa  976    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0249  putative lipoprotein  71.32 
 
 
843 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.717824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1165  putative lipoprotein  70.93 
 
 
865 aa  956    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6177  putative lipoprotein  89.34 
 
 
713 aa  1299    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1890  putative lipoprotein  97.62 
 
 
713 aa  1407    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1902  putative lipoprotein  89.34 
 
 
713 aa  1299    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0095  putative lipoprotein  71.18 
 
 
730 aa  976    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0329  putative lipoprotein  71.18 
 
 
843 aa  975    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1766  glycogen debranching protein  71.47 
 
 
843 aa  963    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.773326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1677  putative lipoprotein  71.18 
 
 
843 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1372  putative lipoprotein  86.26 
 
 
713 aa  1238    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1925  putative lipoprotein  89.62 
 
 
713 aa  1302    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981869  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1820  putative lipoprotein  100 
 
 
713 aa  1434    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3279  putative lipoprotein  48.42 
 
 
689 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06473  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
668 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0475934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>